تاثیر تغییرات ژنتیکی بر بیان ژن‌های سلول سرطانی

به گزارش واحد ژنتیک پایگاه اطلاع رسانی علوم آزمایشگاهی ایران، محققان مرکز جامع سرطان دان ال دانکن کالج پزشکی بیلور و مرکز توالی ژنوم انسانی میزان تأثیرگذاری اشکال تنوع ژنتیکی به نام ژرملاین یا تنوع ساختاری ارثی بر بیان ژن در سرطان های انسانی را بررسی کردند. این یافته ها نشان می دهد که تغییرات ساختاری ژرمینال کاندیدهای بالقوه برای آزمایش های ژنتیکی سرطان، از جمله ژن هایی با پیامدهای هدف گیری درمانی را نشان می دهد. تنوع ساختاری یکی از انواع تنوع ژنومی است و می تواند مفید، خنثی باشد، یا اگر بر نواحی مرتبط با عملکرد ژنوم تاثیر بگذارد، می تواند به طور جدی بر عملکرد ژن تاثیر بگذارد و به بیماری، از جمله سرطان کمک کند. تغییرات ساختاری تفاوت های بزرگ تری در ژنوم است که زمانی رخ می دهد که قطعه ای از DNA تکثیر، حذف یا جابجا می شود، که می تواند بر دستورالعمل های ژنتیکی کدگذاری شده در DNA تأثیر بگذارد و بر بیان ژن های مجاور تأثیر بگذارد. مطالعات قبلی به رهبری محققان نشان داده اند که تغییرات ساختاری که در انواع سلول های خاص مانند سلول های پستان رخ می دهد، می تواند به شدت بر بیان ژن تأثیر بگذارد به گونه ای که به تبدیل سلول سالم پستان به سلول سرطانی کمک می کند.

مشخص است که تنوع ساختاری ژرمین ها همچنین می تواند به مشخصات مولکولی سرطان ها کمک کند. در این مطالعه میزان سهم آن مطالعه می شود. محققان با داده های توسعه یافته توسط کنسرسیوم Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes کار کردند که شامل داده های توالی ژنوم کل از 2658 سرطان در 38 نوع تومور که شامل 20 بافت اصلی منشاء می شود. تیم این داده ها را با داده های RNA ادغام کرد تا ژن هایی را شناسایی کند که بیان آن ها با تغییرات ساختاری مجاور مرتبط است. محققان دریافتند که بیشتر ژن های مرتبط با تغییرات ساختاری ژرم لزوماً نقش خاصی در سرطان ندارند، اما برای برخی از ژن ها، تنوع بیان ممکن است با شرایط دیگر مرتبط باشد. به عنوان مثال، اگر این ژن ها یک ارتباط ثابت سرطانی یا ارتباطی با بقای بیمار داشته باشند، تغییرات ساختاری به طور قابل تصوری می تواند به سرطان کمک کند. این مطالعه نشان می دهد که تنوع ساختاری ژرمین یک کلاس طبیعی از تنوع ژنتیکی را نشان می دهد که در طول نسل ها منتقل می شود و ممکن است نقش مهمی در توسعه سرطان داشته باشد. محققان پیشنهاد می کنند که زیرمجموعه ای از ژن ها با ارتباط مرتبط با سرطان که در این مطالعه به وجود می آیند، کاندیدهای قوی برای تحقیقات بیشتر در مورد ارزش آنها در آزمایش ژنتیکی است.